More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2235 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  68.64 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  63.56 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  63.87 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  57.5 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  55 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 		 183 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  41.9 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 341 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 355 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.19 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.35 
 
 		 336 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>