More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2339 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  225  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  67.54 
 
 		 114 aa  158  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 111 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 111 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  56.19 
 
 		 244 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  56.19 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  56.73 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  56.19 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  54.72 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  56 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.04 
 
 		 119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  55.24 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  55.88 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  56.44 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  49.51 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  58.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  49.5 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  49.5 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  49.07 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  48.74 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  51.49 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  55.08 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  48.7 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  47.41 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  51.46 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  51.92 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  60.76 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  54.72 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  54.9 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 108 aa  95.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  50.86 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 298 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  45.36 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  46.74 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  50.5 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  54.46 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 291 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>