270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3125 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  219  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  99.09 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 291 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  54.37 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  50.45 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  52.48 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  47.75 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  52.48 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  52.48 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 287 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  42.59 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 227 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  51.96 
 
 		 244 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  50 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  48.48 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  46.46 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  46.46 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  49.55 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  43.12 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.14 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 284 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  43.64 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 118 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  48.11 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 		 309 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 276 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  45.87 
 
 		 270 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  51.81 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  47.57 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  44.55 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>