More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3822 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  95.79 
 
 		 100 aa  186  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 111 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 99 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  63.16 
 
 		 101 aa  133  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  61.05 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  63.04 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  58.7 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  56.52 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0034  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10342  normal  0.220485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  39.13 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  34.78 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  33.7 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  33.7 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  36.56 
 
 		 244 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 298 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  32.95 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  32.95 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 118 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  34.41 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>