296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2515 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  100 
 
 		 97 aa  203  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  64.89 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  64.89 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  61.7 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 103 aa  129  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 99 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  56.52 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  56.52 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  34.78 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  34.78 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  34.78 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0034  hypothetical protein  51.67 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10342  normal  0.220485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  33.7 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  35.29 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  33.7 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  34.07 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  34.12 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>