238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4202 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
106 aa  213  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  75.24 
 
 
105 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  76.53 
 
 
105 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  60 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  59.05 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  59.38 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
102 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  52.43 
 
 
101 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
106 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  50.52 
 
 
97 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  52.13 
 
 
97 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
99 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  47.87 
 
 
95 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
95 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 
100 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  46.32 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  48.45 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
113 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  48 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 
107 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  41.24 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
113 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  41.24 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  41.24 
 
 
244 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  41.24 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  49.33 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0034  hypothetical protein  65.52 
 
 
65 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10342  normal  0.220485 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  37.63 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  38.71 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  40.43 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  38.71 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>