208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1346 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
127 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  75.26 
 
 
109 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.52 
 
 
105 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  65.42 
 
 
107 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 
107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 
107 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  63.55 
 
 
107 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 
107 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 
106 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
120 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  62.26 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.98 
 
 
109 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  62.96 
 
 
114 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.55 
 
 
106 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  65.09 
 
 
109 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  60.75 
 
 
113 aa  135  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  64.95 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 
108 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  67.03 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  63.55 
 
 
107 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 
110 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
113 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
113 aa  120  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  60.95 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 
108 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
113 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.86 
 
 
84 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
114 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
111 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
111 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 
111 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  51.4 
 
 
111 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
111 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
111 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 
109 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  53.61 
 
 
111 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 
119 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
112 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  54.17 
 
 
111 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  54.17 
 
 
244 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  54.17 
 
 
123 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
227 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
108 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  44.68 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
110 aa  95.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 
104 aa  95.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  54.65 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  45.74 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  44.64 
 
 
120 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 
130 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
123 aa  87.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 
119 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
298 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.12 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  47.19 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 
114 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
155 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  44.58 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  41.44 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  44.58 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  39.6 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>