More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4216 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  92.38 
 
 		 111 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  91.59 
 
 		 111 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  87.74 
 
 		 111 aa  196  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  91.35 
 
 		 111 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  87.74 
 
 		 111 aa  196  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  87.85 
 
 		 111 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  87.85 
 
 		 111 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  85.58 
 
 		 244 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  85.58 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  85.58 
 
 		 111 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  85.58 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 		 113 aa  151  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  65.74 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  71.15 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  63.27 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  59.41 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 109 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.7 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  55.67 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 298 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  43.86 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  44.34 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 284 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  45.61 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  54.84 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  50.42 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  41.88 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  47.12 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  50.59 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  45.83 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  43.93 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  43.4 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  57.5 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  48.86 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  40.57 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  45.28 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2663  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.68511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  41.59 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>