172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0519 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  80 
 
 		 105 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  60.42 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  45.92 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  46.32 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  43.75 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  44.9 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  45.74 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  47.96 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  43.81 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  46.91 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  39.42 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  44.74 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0034  hypothetical protein  55.74 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10342  normal  0.220485 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  35.11 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  35.35 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>