255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1580 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
106 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 
107 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
114 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
127 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  50.5 
 
 
107 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 
106 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
113 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
107 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
107 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
105 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
107 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
114 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  48.45 
 
 
113 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
111 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
111 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
115 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
291 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
111 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
114 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  38.32 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  39.81 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
155 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  38.32 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  38.53 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  38.32 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  38.32 
 
 
244 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
227 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  36.29 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  36.29 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  38.83 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  44.58 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
298 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.05 
 
 
287 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  40.2 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>