218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2347 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  95.41 
 
 
109 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  87.16 
 
 
115 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  89.62 
 
 
114 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  85.32 
 
 
108 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  88.24 
 
 
113 aa  187  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  82.08 
 
 
120 aa  183  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  73.2 
 
 
109 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  69.07 
 
 
107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.22 
 
 
105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  65.09 
 
 
127 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 
107 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.09 
 
 
107 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  67.01 
 
 
107 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  62.62 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.95 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  69.07 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.22 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.17 
 
 
107 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 
111 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 
111 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  60.82 
 
 
111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
120 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  61.22 
 
 
244 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  61.22 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  60.82 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  61.86 
 
 
111 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  61.22 
 
 
123 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  61.86 
 
 
227 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  53.21 
 
 
110 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  62.07 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
119 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.19 
 
 
119 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  47.87 
 
 
123 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
158 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.29 
 
 
84 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  55.91 
 
 
108 aa  100  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 
120 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 
298 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  51.06 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  55.42 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
284 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
109 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  43.62 
 
 
124 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
119 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  43.62 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  51.06 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  38.74 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  46.46 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
117 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
124 aa  84  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  44.34 
 
 
118 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 
118 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.62 
 
 
287 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  51.22 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>