287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3864 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 119 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  96.64 
 
 		 119 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  83.19 
 
 		 119 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  77.31 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  73.95 
 
 		 120 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  84.87 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  74.17 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  75 
 
 		 119 aa  153  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  73.11 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  61.98 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  64.81 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  60.5 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  58.04 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  61.02 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  55.96 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  66.95 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  61.74 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  60.95 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  59.41 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  57 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  51.35 
 
 		 113 aa  110  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 113 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  51.96 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3211  regulatory protein ArsR  55.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  49.55 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  48.65 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 113 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  45.95 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  52.81 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  50.53 
 
 		 117 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 298 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  52.94 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  43.93 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 291 aa  87  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  45.92 
 
 		 309 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>