More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1388 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 		 110 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 111 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 111 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  63.64 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 123 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  62.86 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 111 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 111 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  64.49 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  64.49 
 
 		 244 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  64.49 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 227 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  51.79 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  45.54 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  51.43 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.66 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  52.58 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  54.72 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.6 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  51.96 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  48.54 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 298 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  45.69 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  51.65 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  43.69 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  44.25 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  53.26 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  45.19 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  47.92 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  47.92 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  47.71 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 284 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  44.55 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>