220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2289 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 115 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.42 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 109 aa  147  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  64.76 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  73.2 
 
 		 109 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  65.71 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  64.76 
 
 		 107 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.01 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.95 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.92 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  68.18 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  59 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  57.84 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  57.84 
 
 		 244 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  57.84 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 227 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  63.92 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  44.79 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.75 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  53.12 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  44.33 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  47.96 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 298 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  48.96 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  46 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 284 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 287 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  48.45 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  44.04 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  40.59 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  40.59 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>