More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1584 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  60.95 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.98 
 
 		 105 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  60.95 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.48 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.8 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 114 aa  120  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  56.19 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.1 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  65.98 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  57.41 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.2 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  50.47 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  50.94 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 298 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  50.47 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  50.47 
 
 		 244 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  44.44 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.48 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 284 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  36.7 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  36.7 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  41.3 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  40.82 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  41.28 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  47.73 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  42.48 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  46.6 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  39.45 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  37.38 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  38.53 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>