242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3941 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 107 aa  221  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  91.59 
 
 		 107 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  85.98 
 
 		 107 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  83.18 
 
 		 106 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  81.31 
 
 		 107 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  77.57 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 84 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.52 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  74.77 
 
 		 107 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 		 107 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  65.09 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.17 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  57.01 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  53.77 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  63.75 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  54.64 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  53.61 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  53.61 
 
 		 244 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  53.61 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 227 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 119 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  44.68 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  47.87 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 284 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  46.53 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  40.4 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 298 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  47.87 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  51.81 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3211  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>