More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4893 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  69.44 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  64.81 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  70.41 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  58.41 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.64 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 119 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  66 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  58.12 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  56.88 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  60.61 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  52.42 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  54.05 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  52.88 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.33 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  56.41 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  57 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  56 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  58.82 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3211  regulatory protein ArsR  63.54 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 115 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  47.87 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  46.59 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  42.16 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  46.59 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  46.59 
 
 		 244 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 227 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  38.89 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 291 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  40.43 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  38.53 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  43.96 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>