177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3828 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  91.67 
 
 		 107 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  86.9 
 
 		 107 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  84.52 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  82.14 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  76.19 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.9 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.86 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.56 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  57.83 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.25 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  64.38 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  54.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.86 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  53.42 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.86 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  51.43 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  49.3 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  52.86 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  52.05 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  52.05 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  52.05 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  53.62 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  47.22 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  54.29 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  46.34 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.86 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  46.05 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  45.07 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  45.07 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  45.95 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>