234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1527 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  93.2 
 
 
109 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 
115 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  71.84 
 
 
111 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  71.84 
 
 
111 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 
111 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 
111 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  69.9 
 
 
111 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  69.9 
 
 
244 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  69.9 
 
 
123 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  69.9 
 
 
227 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  68.93 
 
 
111 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  68.93 
 
 
111 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  69.9 
 
 
123 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  66.02 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  68.04 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  61 
 
 
113 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
113 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  59.22 
 
 
114 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 
106 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 
107 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
110 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 
107 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
113 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  55.24 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  56.73 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 
108 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
114 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  54.37 
 
 
117 aa  106  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
115 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
106 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
114 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
109 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
108 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  56.86 
 
 
110 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
120 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
107 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
110 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 
109 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  50.47 
 
 
113 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  54.44 
 
 
110 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
107 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
127 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  45.87 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  51.49 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  47.57 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  50 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
298 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  42.72 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  49.02 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  54.43 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
284 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  49.04 
 
 
119 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  48.54 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  44.55 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  48.08 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
111 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
109 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
155 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  43.75 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  43.75 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
117 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3828  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
84 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  55 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  48.39 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>