258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1736 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1736  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0446169  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  62.83 
 
 		 244 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 227 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  63.89 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  63.73 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  61.47 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  54.62 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  51.52 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  59.04 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.66 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  48.08 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  48.84 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  44.55 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  48.11 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 118 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  48.11 
 
 		 120 aa  93.2  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2218  ArsR family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 298 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  49.52 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  45.54 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  45.22 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  40.95 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  46.67 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 284 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  46.6 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>