More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2480 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 298 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  55.06 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 284 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  54.22 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  50.59 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  50.59 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  52.22 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  52.22 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 227 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  52.22 
 
 		 244 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  52.22 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  51.76 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 111 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  55.41 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  49.41 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 287 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 291 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  48.24 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  45.88 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 		 309 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  47.5 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  49.35 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  38.54 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  43.18 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>