297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3653 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 
119 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  51.76 
 
 
114 aa  86.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  48.31 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  49.44 
 
 
120 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
119 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  48.28 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0519  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  hitchhiker  0.00250368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  46.07 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  34.41 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  51.72 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  45.24 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  42.11 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  38.71 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  36.56 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  36.56 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1914  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  41.76 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  41.38 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  42.86 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  39.56 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  39.56 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  39.56 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  37.63 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  46.05 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>