270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3119 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  80.65 
 
 		 124 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  80.65 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 284 aa  170  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  65.79 
 
 		 117 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.65 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  63.55 
 
 		 298 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  54.22 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 110 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  45.83 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  45.83 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 227 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  45.83 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  43 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  36.89 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  44.04 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  43 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  40.2 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  42.59 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  42.2 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  40 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  40.71 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  40.37 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  37.61 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  43.48 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1527  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.546926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>