More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08198 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
98 aa  200  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  95.92 
 
 
98 aa  193  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  95.92 
 
 
98 aa  193  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  37.63 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  37.63 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  32.58 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4202  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  32.58 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  28.41 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
355 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 
120 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  31.25 
 
 
112 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  30.95 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
291 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  29.76 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
110 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  28.24 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
270 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
276 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  31.4 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  31.4 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  29.11 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 
270 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
284 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  28.4 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>