More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8615 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  236  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 110 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 355 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 302 aa  80.5  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  44.12 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.39 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.39 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4565  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  32.1 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  32.1 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  39.39 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 257 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 307 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.21 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>