More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0687 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  278  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.08 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  37.04 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.62 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  27.69 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  40.51 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  31.03 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  33.64 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>