More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2048 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  75.4 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  79.81 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  72.12 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  68.27 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  57.52 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  62.37 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  53 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  49.59 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.92 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  44.23 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.1 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  33.06 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  31.91 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  41.76 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.96 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0808  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.89 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>