More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1314 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  43.48 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  38.03 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.54 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  48.21 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>