More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2300 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
99 aa  205  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  62.2 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  62.2 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  62.2 
 
 
90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  60.98 
 
 
96 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  59.76 
 
 
114 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  58.54 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  56.96 
 
 
89 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  51.22 
 
 
125 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
85 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
87 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  49.43 
 
 
97 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
99 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  47.56 
 
 
93 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  46.59 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
96 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  52.5 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.3 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  32.26 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
169 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.8 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.08 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  49.21 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  49.21 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.08 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>