More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0720 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 116 aa  236  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  70.71 
 
 		 103 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  58.25 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  52.31 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  54.1 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.94 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  34.18 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 		 330 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  45.76 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>