More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1976 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  216  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  81.73 
 
 		 104 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  79.81 
 
 		 104 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  78.7 
 
 		 108 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  79.81 
 
 		 104 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  78.85 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  74.76 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.09 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.38 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.76 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>