More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4988 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  98.89 
 
 
90 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  97.78 
 
 
90 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  97.78 
 
 
90 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  96.67 
 
 
90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  95.56 
 
 
90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  67.42 
 
 
94 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  59.34 
 
 
125 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
114 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  60.98 
 
 
99 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  55.7 
 
 
87 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
85 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  61.84 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
103 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
88 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
86 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  44.16 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  45.24 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  55.38 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  45.57 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  34.57 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
169 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  41.46 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  35.16 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  34.04 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>