More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2149 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 106 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  66.35 
 
 		 105 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  68.22 
 
 		 108 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  67.65 
 
 		 106 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 106 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  54.72 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  51.43 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 		 107 aa  127  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  50.48 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  49.04 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  48.04 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  29.59 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.56 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  30.1 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  31.73 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  30.39 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  29 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  29.13 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>