More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0489 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
107 aa  223  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  83.18 
 
 
107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  81.31 
 
 
107 aa  192  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  82.52 
 
 
111 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  77.57 
 
 
107 aa  182  9e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  70.09 
 
 
108 aa  168  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  56.19 
 
 
105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 
106 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  58.16 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
106 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  50.48 
 
 
108 aa  127  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 
108 aa  127  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
104 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  43.4 
 
 
113 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  43.4 
 
 
106 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
120 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.05 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 
109 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
115 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.32 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  30.69 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  29.41 
 
 
113 aa  67  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>