More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7113 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 105 aa  206  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  55.77 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 		 99 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  53.19 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  42 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  49.45 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  50.54 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.1 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  31.31 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  36.19 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>