More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2826 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  56.98 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 113 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.57 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  43.68 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.68 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  36.84 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 337 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>