More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5412 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 125 aa  243  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 145 aa  243  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 125 aa  243  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  74.42 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  75 
 
 		 135 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  72.44 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  76.92 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  80.56 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  67.2 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  77.97 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  77.97 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  81.45 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  79.59 
 
 		 118 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  79.59 
 
 		 118 aa  153  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  70.3 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  73 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  65.45 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  66.02 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  61.47 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  63.81 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  65.26 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  64.86 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  47.15 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  57.41 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  57.41 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  31.82 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  34.82 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  33.67 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>