32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2208 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  203  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  48.84 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  44.71 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  50.68 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  53.95 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  56.58 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  48.68 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>