More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2653 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  84.55 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  75.81 
 
 		 135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  75.81 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  77.24 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  73.5 
 
 		 138 aa  169  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  80.58 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  78.26 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  78.26 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  67.77 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  69.52 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  76.86 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  70.37 
 
 		 113 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  70.09 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  82 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  76.92 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  76.92 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  76.92 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  66.97 
 
 		 119 aa  139  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  67.92 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  61.9 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  66.32 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  68.92 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  58 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  52.68 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  64.15 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  64.15 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39.81 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  37.62 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  46.27 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.03 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.95 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.48 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30.59 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.46 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  40.3 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>