More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0539 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  67.92 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  63.33 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  65.09 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  60.71 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  63.21 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  61.46 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  57.14 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  59.6 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  54.26 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  57.61 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  54.26 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  61.8 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  55.68 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  52.69 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  42.47 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  46.27 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 		 399 aa  52  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  28.44 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  31.58 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>