More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3317 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  89.81 
 
 
113 aa  186  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  67 
 
 
111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 
107 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 
117 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 
117 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 
117 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  67 
 
 
110 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  69.15 
 
 
118 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  62.14 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  63 
 
 
109 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  69.47 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  58.33 
 
 
109 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
125 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.58 
 
 
111 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  61.05 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 
124 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 
119 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 
119 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 
119 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
119 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
119 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  54.02 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 
112 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
127 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
133 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
399 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
245 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  39.34 
 
 
105 aa  48.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
120 aa  47.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  28.92 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5569  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
235 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  37.29 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
122 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 
109 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  37.7 
 
 
125 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  37.7 
 
 
125 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
226 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>