166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4325 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 133 aa  259  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  55 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 103 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  50.44 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  40 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  45.74 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  43.18 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  40.91 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>