More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
119 aa  234  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  84.87 
 
 
119 aa  204  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  78.15 
 
 
119 aa  187  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  79.46 
 
 
119 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  76.47 
 
 
119 aa  184  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  69.64 
 
 
119 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  60.71 
 
 
124 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  61.17 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 
111 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.55 
 
 
111 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 
111 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
151 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 
109 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  53.06 
 
 
118 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  54.17 
 
 
111 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 
107 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  58.89 
 
 
112 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  49.5 
 
 
108 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  52.17 
 
 
110 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  50.45 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  52.33 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  39.08 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39.33 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  48.44 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
241 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
241 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  45.16 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
337 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0370  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
232 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03630  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
232 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00814661  hitchhiker  0.00000000608889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  29.35 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  42.25 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>