More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4551 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  100 
 
 
110 aa  218  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  78.12 
 
 
107 aa  141  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  67 
 
 
108 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  72.92 
 
 
151 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  73.4 
 
 
111 aa  140  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  66.36 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  65.42 
 
 
117 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  65.42 
 
 
117 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  65.42 
 
 
117 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 
111 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 
113 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  70.65 
 
 
118 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  68.27 
 
 
134 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  69.66 
 
 
168 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
111 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  59.22 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  57.41 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  59.79 
 
 
125 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  56.52 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 
119 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
119 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  55.67 
 
 
118 aa  103  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 
124 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 
119 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  53.93 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
399 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
113 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
106 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 
106 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  30.67 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
90 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  34.02 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  42.37 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  36.23 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>