More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1508 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  100 
 
 
112 aa  224  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 
115 aa  136  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  58.18 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  46.25 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  37.23 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  39.56 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
310 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  34.09 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  40.26 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
305 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.71 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  32.5 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>