More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5055 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  73.79 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  73.83 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  65.14 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  66.36 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  65.35 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  73.47 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  64.49 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  64.65 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  60.71 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  62.86 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  65.59 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  61.32 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  64 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  61.39 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  63.64 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  67.31 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  67.31 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  69.86 
 
 		 94 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  62.5 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  62.5 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  62.5 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  43.12 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  53.95 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.51 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.74 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  42.2 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  35.04 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  40.62 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  40.62 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>