More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3282 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  68.69 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  64.58 
 
 
133 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
116 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
122 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  46.94 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.62 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  44.19 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  44 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
226 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
106 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
228 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  33 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  40.91 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.301684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>