More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1535 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  74.19 
 
 		 118 aa  167  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 119 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.05 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  27.36 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  29.13 
 
 		 105 aa  57  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  34.41 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  32.22 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  28.85 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  31.3 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  31.3 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  31.96 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  28.85 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 330 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.96 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>