More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2464 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  89.26 
 
 
121 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
98 aa  133  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
112 aa  103  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  50 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
250 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
250 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
250 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 
263 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.78 
 
 
268 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
268 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
106 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 
106 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
109 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.46 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  34.12 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  40.58 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  32.29 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  34.92 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  27.78 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  28 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
104 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>