More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0876 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
105 aa  215  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4522  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  87  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  87  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1359  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  31.18 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  43.08 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  36.23 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 
230 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
258 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1071  transcriptional regulator ArsR family  34.09 
 
 
227 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
349 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
328 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
437 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  36.76 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  30.91 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  51.06 
 
 
341 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  32.93 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
340 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 
99 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
132 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6346  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
89 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
341 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
120 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
341 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  29.27 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
339 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>